A Astramab informa que, caso ocorra concentração de demanda de passageiros nos terminais, horários extras serão disponibilizados, a partir das 11h, com as embarcações saindo a cada 15 minutos, caso o fluxo de passageiros exija.

A falta de condições para atracar embarcações em períodos de maré baixa do Terminal Hidroviário de Vera Cruz é o que determina as paradas momentâneas do sistema. O canal de navegação do terminal não tem profundidade suficiente.

Os catamarãs da linha Salvador-Morro de São Paulo operam normalmente. As saídas ocorrem às 9h, 10h30, 13h e 14h30. Já do terminal em Morro de São Paulo, os horários são: 9h, 11h30 e 15h. As passagens podem ser adquiridas no momento do embarque nos guichês do Terminal Náutico, no Comércio.